第三轮原计划进行八场比赛，但四支球队因自身原因无法参赛，按照规则被判0:3负于对手，因此本轮实际进行了四场比赛。其中在18日进行的泾川文汇和济南兴洲的“黑马之争”引来关注。上轮比赛中冠球队泾川文汇通过点球大战淘汰中超豪门北京国安，济南兴洲则战胜中超球队长春亚泰。
本轮对决，济南兴洲率先由成源打进两球，国洪涛在上半场即将结束时帮助泾川文汇扳回一球。易边再战，拜合拉木为济南兴洲打进第三球；泾川文汇没有放弃，由江磊通过直接任意球再追一分，但最终仍以2:3不敌对手无缘八强。
另外三场比赛中，沧州雄狮18日以3:1战胜广州队，浙江队19日以3:0大胜广州城，成都蓉城19日以3:0击败梅州客家，获胜球队延续了他们在联赛中的强势表现。
八强赛对阵随之出炉：山东泰山对武汉三镇，沧州雄狮对上海申花，上海海港对成都蓉城，济南兴洲对浙江队。济南兴洲面对中超排名第三的浙江队，能否“一黑到底”值得关注。
足协杯八强赛、半决赛和决赛将于2023年1月4日至15日在苏州举行。八强赛将采取两回合淘汰制，半决赛和决赛均为单场定胜负。
本轮比赛前，足协杯联合冠名赞助商燕京啤酒共同发起的“种子计划进校园”公益活动以及足协杯冠军奖杯巡展在海口和晋江两个赛区进行，不少当地球迷和踢球的小朋友现场参与。
